经常有会计朋友，包括一些老板问我，退税函调期间可以做退税申报吗？关于这个问题，我们从两个维度来谈。
一、外贸退税
假如说你们公司是外贸退税，本次申报退税你用了十张发票，由于存在着疑点，税务局凭在手的资料没有办法消除疑点，他就会进行函调。函调时间断则一两个月，长则半年甚至一年。
在你申报退税的十张发票中，税务局抽出了两张发票，来自两个供应商，一个供应商一张。出现这种情况，那你这一次的十张发票的税都不能退回来，但你仍然可以申报非函调供应商的出口退税发票。
有一些会计或者老板就犯糊涂，认为税务局退税函调还没有结束，就没办法做下一次的退税申报，这种理解是错误的。因为税务局只是对那两个供应商开出来的发票有疑点，其他的供应商他并没有函调，并没有疑点，其他的供应商在下个月或者是以前月份开过的发票，涉及到退税的，你也是可以做退税申报的。
二、生产免抵退退税
当一个生产型出口企业的出口量增速太快，或者说你退税增速太快，税务局凭在手的资料没办法解除你的退税疑点，他也会函调，往往是抽取你出口产品材料的主料来进行函调，通常持续时间在40-60天。
在函调期间你是不能够申报下一次退税的，而且本次你申报的退税，在函调没有结束期间，你也是不能退税的，这一点和外贸企业是不一样的。
为什么会这样子呢？因为生产退税和外贸退税逻辑和原理是不一样的。外贸退税，你只是凭出口用到的采购发票去退税的；而生产退税，是凭出口报关单和采购发票，和你的进项以及退税率有关系。
在做生产退税的时候，会录入一个上期的期末留底，而上期的期末留底跟你每个月增值税的纳税申报有关系。所以生产退税，只要做函调期间税是退不下来，而且你还不能申报下一期的退税。
我见过有这样的生产企业，光退税函调就搞了一年，在一年内他就不能进行退税申报，有好多税款就压在税务局。